Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Atg4aQ8C9S8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Atg4aQ8C9S8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg4aQ8C9S8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg4aQ8C9S8 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Atg4aQ8C9S8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Atg4aQ8C9S8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Atg4aQ8C9S8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4aQ8C9S8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4aQ8C9S8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4aQ8C9S8 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4aQ8C9S8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4aQ8C9S8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4aQ8C9S8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4aQ8C9S8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg4aQ8C9S8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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