Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cnot2Q8C5L3 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms