Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf428Q8C1M2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf428Q8C1M2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf428Q8C1M2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf428Q8C1M2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Znf428Q8C1M2 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf428Q8C1M2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf428Q8C1M2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Znf428Q8C1M2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf428Q8C1M2 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf428Q8C1M2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf428Q8C1M2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf428Q8C1M2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Znf428Q8C1M2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf428Q8C1M2 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Znf428Q8C1M2 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Znf428Q8C1M2 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf428Q8C1M2 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf428Q8C1M2 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Znf428Q8C1M2 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf428Q8C1M2 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Znf428Q8C1M2 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Znf428Q8C1M2 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Znf428Q8C1M2 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Znf428Q8C1M2 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Znf428Q8C1M2 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Znf428Q8C1M2 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf428Q8C1M2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Znf428Q8C1M2 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms