Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
FarsaQ8C0C7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
FarsaQ8C0C7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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