Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
TtpaQ8BWP5 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
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TtpaQ8BWP5 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TtpaQ8BWP5 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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