Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Usp38Q8BW70 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Usp38Q8BW70 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms