Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 A430050A11Rik-201ENSMUST00000195348 646 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Snx17Q8BVL3 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx17Q8BVL3 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Snx17Q8BVL3 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Snx17Q8BVL3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Snx17Q8BVL3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx17Q8BVL3 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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