Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trim6Q8BGE7 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trim6Q8BGE7 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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