Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Atg4bQ8BGE6 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Atg4bQ8BGE6 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Atg4bQ8BGE6 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Atg4bQ8BGE6 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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