Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Htatsf1Q8BGC0 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms