Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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H2-M10.4Q85ZW8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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H2-M10.4Q85ZW8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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H2-M10.4Q85ZW8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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H2-M10.4Q85ZW8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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H2-M10.4Q85ZW8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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H2-M10.4Q85ZW8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
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H2-M10.4Q85ZW8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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H2-M10.4Q85ZW8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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H2-M10.4Q85ZW8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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H2-M10.4Q85ZW8 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
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