Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
H2-M10.6Q85ZW5 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
H2-M10.6Q85ZW5 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms