Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Liat1Q810M6 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms