Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NischQ80TM9 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NischQ80TM9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms