Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Dsg1bQ7TSF1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms