Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Dsg1cQ7TSF0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms