Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Prrc2bQ7TPM1 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms