Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smim12Q78RX3 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms