Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Nudcd1Q6PIP5 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms