Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Smchd1Q6P5D8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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