Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrimpolQ6P1E7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms