Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Pram1Q6BCL1 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms