Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
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PtprdQ64487 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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PtprdQ64487 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
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PtprdQ64487 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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PtprdQ64487 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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PtprdQ64487 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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PtprdQ64487 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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PtprdQ64487 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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PtprdQ64487 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
PtprdQ64487 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
PtprdQ64487 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
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