Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col4a5Q63ZW6 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 591.9 ms