Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Taf6Q62311 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Taf6Q62311 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Taf6Q62311 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Taf6Q62311 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Taf6Q62311 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Taf6Q62311 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Taf6Q62311 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Taf6Q62311 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms