Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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SspnQ62147 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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SspnQ62147 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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SspnQ62147 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SspnQ62147 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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SspnQ62147 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SspnQ62147 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SspnQ62147 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SspnQ62147 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SspnQ62147 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SspnQ62147 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SspnQ62147 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SspnQ62147 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SspnQ62147 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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SspnQ62147 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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SspnQ62147 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SspnQ62147 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SspnQ62147 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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SspnQ62147 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SspnQ62147 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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SspnQ62147 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SspnQ62147 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SspnQ62147 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SspnQ62147 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SspnQ62147 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SspnQ62147 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SspnQ62147 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SspnQ62147 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SspnQ62147 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SspnQ62147 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SspnQ62147 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SspnQ62147 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SspnQ62147 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SspnQ62147 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SspnQ62147 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SspnQ62147 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SspnQ62147 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SspnQ62147 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SspnQ62147 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SspnQ62147 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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