Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm1Q61508 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm1Q61508 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm1Q61508 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm1Q61508 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm1Q61508 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm1Q61508 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ecm1Q61508 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ecm1Q61508 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms