Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
AcanQ61282 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms