Protein–RNA interactions for Protein: Q61191

Hcfc1, Host cell factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,045 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1Q61191 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hcfc1Q61191 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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