Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tnfrsf8Q60846 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms