Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Samhd1Q60710 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms