Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Prdm1Q60636 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Prdm1Q60636 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Prdm1Q60636 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm1Q60636 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm1Q60636 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm1Q60636 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Prdm1Q60636 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm1Q60636 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm1Q60636 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prdm1Q60636 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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