Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Tsr1Q5SWD9 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tsr1Q5SWD9 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Olfr362-201ENSMUST00000100144 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tsr1Q5SWD9 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tsr1Q5SWD9 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tsr1Q5SWD9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tsr1Q5SWD9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tsr1Q5SWD9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tsr1Q5SWD9 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tsr1Q5SWD9 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tsr1Q5SWD9 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tsr1Q5SWD9 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tsr1Q5SWD9 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Tsr1Q5SWD9 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tsr1Q5SWD9 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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