Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Sft2d1Q5SSN7 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms