Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TefmQ5SSK3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms