Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Gm43787-201ENSMUST00000197792 1037 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Phf12Q5SPL2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms