Protein–RNA interactions for Protein: Q52KB6

C2cd3, C2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd3Q52KB6 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
C2cd3Q52KB6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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