Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Trp53i11Q4QQM4 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms