Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q4

Pydc3, Pyrin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pydc3Q3V3Q4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pydc3Q3V3Q4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pydc3Q3V3Q4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pydc3Q3V3Q4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pydc3Q3V3Q4 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pydc3Q3V3Q4 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pydc3Q3V3Q4 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms