Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC051142Q3V0M8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms