Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Ccl20-202ENSMUST00000113437 794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Ccl20-203ENSMUST00000186832 772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm43149-201ENSMUST00000198162 1422 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm43531-201ENSMUST00000200676 1114 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 4930458B22Rik-201ENSMUST00000209339 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm20063-201ENSMUST00000220757 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Olfr862-201ENSMUST00000073765 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Psmd10-201ENSMUST00000033805 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm44509-201ENSMUST00000205400 1324 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc43Q3V0L5 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms