Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms