Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Chpf2Q3UU43 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms