Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
E130208F15RikQ3UPV3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms