Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Q3UPC7 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms