Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULA2

Btrc, F-box/WD repeat-containing protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtrcQ3ULA2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
BtrcQ3ULA2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
BtrcQ3ULA2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
BtrcQ3ULA2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
BtrcQ3ULA2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
BtrcQ3ULA2 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
BtrcQ3ULA2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
BtrcQ3ULA2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
BtrcQ3ULA2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
BtrcQ3ULA2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
BtrcQ3ULA2 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
BtrcQ3ULA2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
BtrcQ3ULA2 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
BtrcQ3ULA2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
BtrcQ3ULA2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
BtrcQ3ULA2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms