Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssbp4Q3U4B1 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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