Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q3U1D9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U1D9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Q3U1D9 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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