Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Srsf6Q3TWW8 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Srsf6Q3TWW8 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms