Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccndbp1Q3TVC7 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccndbp1Q3TVC7 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms